La vita privata: moglie e figli
Sposato con Paula de La Fuentes dal 1999, Zanetti e la moglie hanno tre figli: Sol, Ignacio e Tomas, nati rispettivamente nel 2005, 2008 e 2012 e vivono a Como. Javier Zanetti ha scelto Ivan Zamorano, ex calciatore dell’Inter, come padrino di Sol, mentre Ivan Cordoba, un altro ex calciatore dell’Inter, come padrino di Ignacio.